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O CNPEM compõe um ambiente científico de fronteira, multiusuário e multidisciplinar, com ações em frentes do Sistema Nacional de CT&I. Organização Social do MCTI, é impulsionado por pesquisas que impactam as áreas de saúde, energia, materiais renováveis e sustentabilidade.

Responsável pelo Sirius, maior equipamento científico já construído no País, o CNPEM hoje desenvolve o projeto Orion, complexo laboratorial para pesquisas avançadas em patógenos. Equipes altamente especializadas em ciência e engenharia, infraestruturas sofisticadas abertas à comunidade científica, linhas estratégicas de investigação, projetos inovadores com o setor produtivo e formação de pesquisadores e estudantes compõem os pilares deste centro, capaz de atuar como ponte entre conhecimento e inovação.

É responsável pela operação dos Laboratórios Nacionais de Luz Síncrotron, Biociências, Nanotecnologia e Biorrenováveis, e pela Ilum Escola de Ciência, curso de bacharelado em Ciência e Tecnologia, com apoio do MEC.

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